保力溪：车城乡

        彰化县

        万丈深坑溪：满州乡

        清水大排水沟（米粉寮溪）：清水区

        旧虎尾溪：台西乡、四湖乡

        浊口溪

        重溪

        东港溪：新园乡、东港镇

        北港溪：口湖乡、嘉义县东石乡

        嘉义县

        陈有兰溪

        利嘉溪：台东市

        乌溪：台中市龙井区、彰化县伸港乡

        北港溪：云林县口湖乡、嘉义县东石乡

        津林溪（加津林溪）：大武乡

        枋山溪：枋山乡

        七溪：七区

        金崙溪：太麻里乡

        埤日溪：满州乡

        郡大溪

        宝来溪

        急水溪：北门区

        二林溪：芳苑乡

        文里溪（北太麻里溪）：太麻里乡

        眉溪

        石牛溪：恆春镇

        八掌溪：嘉义县布袋镇、台南市北门区

        牛挑湾溪：口湖乡

        洋子溪（洋仔厝溪）：鹿港镇

        高屏溪：林园区、屏东县新园乡

        万大溪

区

        南兴溪：大武乡

        安朔溪：达仁乡、大武乡

        高屏溪：高雄市林园区、屏东县新园乡

        卑南溪：台东市

        港口溪：满州乡

        典宝溪：梓官区、楠梓区

        旭海溪：牡丹乡

        大竹溪：大武乡、太麻里乡

        员林大排：鹿港镇、福兴乡

        九棚溪：满州乡

        大武溪：大武乡

        盐水溪：安南区、安平区

        龙溪：布袋镇

        番雅沟：线西乡、鹿港镇

        刣牛溪：恆春镇

        后堀溪

        八掌溪：布袋镇、台南市北门区

        拉库音溪

        大石盘溪（石盘溪）：枋山乡

        社皆坑溪：车城乡

        塔瓦溪：牡丹乡、台东县达仁乡

        鹿寮溪：满州乡

        爱河：鼓山区、苓雅区

        水里溪

        荖溪

        阿公店溪：永安区、弥陀区

        南仁鬱溪：满州乡

        前溪

        乾溪：牡丹乡

        二仁溪：南区、高雄市茄萣区

        四重溪：车城乡

        率芒溪（士文溪）：枋寮乡、枋山乡

        浊水溪：大城乡、云林县麦寮乡

        美溪

        知本溪：太麻里乡、台东市

        鹿野溪

        大湖口溪

        浊水溪：彰化县大城乡、云林县麦寮乡

        汉宝溪：福兴乡、芳苑乡

        枫港溪：枋山乡

        新虎尾溪：麦寮乡、台西乡

        旧浊水溪：福兴乡

        旗山溪

        菜寮溪

        合欢溪

        三叠溪

        台东县

        白水溪

        南港溪

        太平溪：台东市

        七里溪：枋山乡

        台南市

        清水溪

        社口溪

        溪仔口溪：满州乡

        后港溪：芳苑乡

        塔瓦溪：屏东县牡丹乡、台东县达仁乡

        高雄市

        鱼寮溪：大城乡

        前镇河：前镇区

        加走寮溪

        卡社溪

        林边溪：林边乡、佳冬乡

        南势湖溪：枋山乡

        内寮溪：枋寮乡

        丹大溪

        无水溪：满州乡

        二仁溪：台南市南区、高雄市茄萣区

        朝庸溪：大武乡

        云林县

        乌万溪（大鸟溪）：大武乡

        竹坑溪：枋山乡、车城乡

        猫罗溪

        南湖溪

        港子溪：满州乡

        安良港大排（南势溪）：清水区

        达仁溪：达仁乡

        将军溪：北门区、将军区

        乌溪：龙井区、彰化县伸港乡

        隘寮溪

        大溪：牡丹乡

        后劲溪：楠梓区

        志乐溪

        曾文溪：七区、安南区

        十里溪：枋寮乡（地图未标示）

        朴子溪：东石乡

        拉布拉溪：太麻里乡

        屏东县

        太麻里溪：太麻里乡

        狮子溪：枋山乡

        鹿耳门溪：安南区